在“十二五”期间要打造一个舟山新港航，这个“新”主要体现在四个方面：一是数量上，主要经济指标再翻一番，再造一个舟山港。“十一五”期间，舟山港口货物吞吐量从“十五”末的不到1亿吨增长至2010年的2.2亿吨，沿海运力保有量从189万载重吨增长至403万载重吨，实现了再造一个新港航的目标，“十二五”要再接再厉，在“十一五”末的基础上再造一个舟山新港航，包括货物吞吐量从2亿多吨跨越至4亿吨，沿海船舶运力保有量从400万载重吨翻番至800万载重吨；二是质量上，港航物流发展跃上新台阶。当前，舟山港航物流依然处于“中转+运输”的传统物流阶段，“十二五”期间，要着力发展大宗商品交易，加强信息化和金融服务体系建设，实现向“集资金流、商品流、信息流于一体”的综合型物流阶段转型升级；三是发展面貌上焕然一新。通过“十二五”的发展，舟山港航产业要呈现崭新面貌，建成现代化、国际化、系统化的大港口，现代化就是通过技术改造、科技创新、人才引进促使港口的生产、经营、管理等拥有较高的技术含量，国际化就是要成为中国华东地区重要的海上门户，成为亚太地区重要的国际枢纽港，系统化就是形成以港口为核心，辐射带动全城经济社会发展的格局，包括形成港航联动、港贸联动、港工联动、港城联动的系统发展格局，金融、中介、信息、通关等港航服务系统集中格局，区域集聚、产业集群、资源集约利用的空间发展格局。四是舟山港航在国内外的地位上新台阶，“十二五”期间舟山港口定位为“一枢纽三基地”，即打造亚太地区重要的综合性国际枢纽港，建成我国重要的战略物资储备基地、我国重要的港口物流基地、我国重要的大宗商品交易基地，这个定位如果能顺利实现，那么舟山港航在国内外的地位将显著提升。
